Ну не может моя сестрёнка быть такой милой

17-летний Кёсукэ Косака уже давно не общается со своей младшей сестрой Кирино, которой всего 14 лет. Причины их отчуждения остаются загадкой даже для него самого. Всё началось с того, что Кирино стала избегать брата, бросая на него подозрительные взгляды и игнорируя любые попытки наладить контакт. Казалось, их отношения разрушены навсегда, и шансов на примирение нет.

Однажды Кёсукэ находит в доме DVD с изображением махо-сёдзё. Кому он может принадлежать? Родители точно не интересуются подобным, а уж Кирино, которая работает моделью, — тем более. Однако под обложкой скрывается нечто неожиданное — эроге под названием «Imouto to Koishiyo!». Попытка Кёсукэ осторожно выяснить, чья это игра, заканчивается провалом. Никто из семьи, включая отца-полицейского, яростно ненавидящего отаку, не признаётся в её владении.

В ту же ночь Кирино будит брата пощёчиной и требует серьёзного разговора. В своей комнате она раскрывает шокирующую правду: диск принадлежит ей, а сама она — тайная отаку, увлечённая махо-сёдзё и хентайными играми. Особый интерес Кирино вызывают игры, где главная тема — романтические отношения между братом и сестрой. Это открытие становится началом нового этапа в их сложных отношениях.